2024年11月PyMOL下载-PyMOL

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  ⑴PyMOL是一款功能强大且简单专业的三维分子模型制作软件,同时也是一个由用户支持的分子可视化系统,基于开放源代码,由Schr?dinger维护和分发,为用户提供全面的分子可视化模型处理环境,使用这款软件用户可以进行专业便捷的三维分子模型处理;PyMOL功能丰富齐全专业实用,集成的光线跟踪图形技术,可以渲染具有更平滑的表面边界,进而增强D分子结构的阴影和反射效果,同时该软件支持多种图像格式导入导出,其中包括PDBSDF以及电子密度图等格式文件,可让用户轻松得到符合要求的图像文件。

  ⑵借助此分子可视化系统,可以以D模式对蛋白质,其密度,轨迹和表面进行细微分析

  ⑶原生视网膜分辨率/ k显示支持

  ⑷停靠/取消停靠并重新排列某些面板(生成器,反馈浏览器,音量编辑器)

  ⑸用于打开MAE文件,MTZ文件,地图和轨迹文件的专用对话框

  ⑹新的APBS插件面板

  ⑺pymolrc脚本编辑器,突出显示语法

  ⑻MPEG-和GIF电影导出面板

  ⑼Excel导出器插件(Windows和Mac)

  ⑽通过从文件浏览器拖动到PyMOL窗口来打开文件

  ⑾组合线/非粘合线和棒/ nb_spheres的导线和甘草制图表达别名

  ⑿支持原子级卡通透明度

  ⒀支持多种图像格式导入导出

  ⒁将对齐文件作为对齐对象加载

  ⒂保存核酸的对齐文件

  ⒃内置强大实用的绘图工具

  ⒄支持触控板手势控制

  ⒅完成软件下载双击软件弹出软件安装弹框,点击next按钮即可进行软件安装

  ⒆完成软件安装后点击finish按钮即可关闭弹框并启动软件

  ⒇弹出软件文件注册界面,该界面可以选择文件类型以向PyMOL注册它们

  ⒈关闭注册弹框即可进入三维分组模型操作界面进行图像处理

  ⒉点击软件左上角的文件按钮弹出软件文件新建打开保存导入导出等功能列表,点击即可进行使用

  ⒊点击打开按钮弹出文件管理弹框,点击选择文件即可进行文件添加

  ⒋点击导出按钮可以将完成编辑处理的图像以多种格式导出软件

  ⒌点击设置按钮可以对软件默认功能和参数进行设置和调整

  ⒍使用use_shaders = off和line / nonbonded进行拾取

  ⒎显示预设中的SPC水

  ⒏读取CMS文件时不要忽略插入代码

  ⒐环境光遮挡随机斑块

  ⒑对齐时更新dynamic_measures

  ⒒修复“重建”内存泄漏

  ⒓MPEG导出像素化(anaconda :: ffmpeg与conda-fe :: ffmpeg

  ⒔旧版插件:使用模式对话框(macOS和Windows修复崩溃

  ⒕PyMOL v..维护版本(年月日

  ⒖Windows:修复HTTPS的SSL证书位置

  ⒗处理Python pymolpluginsrc语法错误

  ⒘MAE导入:区分未定义的(<>和值为“ <>”的字符串

  ⒙MAE导出:将未定义的属性写为<>

  ⒚MAE出口属性:b因子,部分费用,ANISOU

  ⒛PyMOL v..维护版本(年月日

  ①修复stick_transparency射线跟踪

  ②修复单击下部命令行崩溃的问题

  ③MAE导出:修复空白(空格链标识符导出

  ④macOS:插件管理器没有XQuartz依赖性

  ⑤PyMOL v..维护版本(年月日

  ⑥使用Python 修复cmd.load_raw(format =“ mmtf”

  ⑦MMTF:避免使用可选的groupType字段崩溃(MMTF v.dev功能

  ⑧修复插件管理器utf-元数据

  ⑨插件安装:忽略“测试”

  ⑩修复macOS .的文件对话框(不要使用本机对话框

  Ⅰ在macOS上修复Zalman立体声

  Ⅱ音量面板:手柄pos <.

  ⅢPyMOL v..维护版本(年月日

  Ⅳ改善macOS .的兼容性

  Ⅴ修复ray_volume回归

  ⅥPyMOL v..维护版本(年月日

  Ⅶ修复macOS .的macOS捆绑包的公证

  Ⅷ使用“ pseudoatom”修复崩溃;h_add”

  Ⅸ修复损坏的CGO对PSE的加载

  Ⅹ修复带有UTF-标签的PSE加载(Python 版本